蛋白质组学研究中心 简介

    内蒙古医学院蛋白质组学研究中心 , 于 2005 年筹建 ,2006 年开始投入试运行,是集科研、教学为一体的开放性实验室,该实验室面积 800m 2 ,包括蛋白质组学研究室、细胞培养室、动物研究室、心血管功能室、电生理室、基因室、免疫室、分析测试室、消毒洗涮室等十多个功能实验室,目前正在建设之中,部分实验室已经开始投入使用。

    本中心现有 ETTAN-2D 电泳系统、 Ettan DALTSIX 中等通量垂直电泳系统、 ProXPRESS2D 凝胶成像分析系统、 Victor3 多标记计数分析仪、倒置荧光显微镜、 GBOX/HR-E-M 凝胶成像分析系统、 TC-K12 基因扩增仪、气套式 CO2 培养箱、 Sigma 低温高速冷冻离心机, MILLI-QB 超纯水仪、全自动高压灭菌器、恒温振荡培养箱、 1379 型自动洗板机、 BiotekEIx 800 酶标仪、超声波细胞粉碎机、自动匀浆机等一批先进的仪器设备,总价值约 200 万元,还有部分先进的仪器设备正在引入。

    本中心以蛋白质组学研究平台为主要特色,同时可以开展基础医学、临床医学、免疫学、分子生物学、肿瘤学、药学、动物学、细胞生物学等领域相关课题的实验研究。自治区第一批双向电泳系统引进中心后,通过不断的探索研究,电泳技术比较成熟,成像分析也可以独立进行,本研究中心凭借其优良的性能和准确可靠的数据已为众多的临床研究和基础研究提供了多方面的服务。

    蛋白质组学研究中心成立以来,先后已有十余名研究生在此开展了相关的课题研究,正在开展的学术研究中国家级课题有两项,省级课题两项,已经完成实验工作的研究生有四名。 2D 电泳仪及 Proxpress2D 蛋白凝胶成像系统已加入环渤海信息服务平台,已申报列入科学仪器协作共用网。

    研究中心目前可以开展的项目有:

    (1) 各种标本的蛋白质提取、纯化及含量的测定、双向电泳分析

    (2) 细胞培养相关实验、抗肿瘤药物体外动物模型抑瘤实验

    (3) 各种标本的核酸分离提取、纯度及含量的测定、凝胶电泳分析、 PCR 扩增分析等

    (4)Western blot 、 ELISA 等免疫学相关实验

    (5) 荧光标记抗体检测、细菌转化、质粒提取等相关实验

 

    附:主要仪器简介

    (一)图像扫描分析— Proxpress2D 蛋白凝胶成像系统

    (大面积 SYPRO TM Ruby 染色蛋白胶成像系统)

  性能:

  •  可扫描面积为 28cm × 33cm (包括带支持膜的凝胶,非支持膜的凝胶及玻璃板间的胶)

  •  可以转动的滤光盘有六对滤光片(激发波长和发射波长)。氙灯电弧光源可以在可见光谱测量发射无限的激发波长。

  •  有上部直射、底部投射及边缘侧射 3 种照明方式可供选择 。氙灯用于照明和从顶部激发,或者从底部透射和从四周边缘侧射(胶位  于两块玻璃板之间),底部照射和透射包括宽广范围的氙灯透射波长及波峰为 366nm 的 UV 灯。

  •  特殊设计的检测系统, -35 ℃ 冷 CCD ,高灵敏度,波长响应范围 400-1050nm ,光子效率高达 80% ,图像位深 16 比特( 65.536 灰度), 信号像素分辨率 9μm 。整个样品区域以 33μm 分辨率方式扫描。

  适用范围:

  •  适合在同一样品中实现多色检测(最多一次四色检测),具有荧光、化学发光、光密度扫描、紫外投射和反射光模式。

  •  可进行蛋白、核酸凝胶图像的高清晰扫描, 经相关的应用软件分析处理图像,获得数据结果。

  (二)双向电泳系统

  1 .第一相:等电聚焦电泳

  ( 1 )简化操作

    胶条槽的设计:采用陶瓷质地的胶条槽,散热迅速,避免“热斑 ” 。加入含样品的溶胶液 , 在放入未经处理的干胶条,便可开始运行,胶条的溶胀、上样及等电聚焦电泳一步完成。

    编程:电泳的编程可利用仪器前面的轻接触式键盘,方便地编辑胶条溶胀的时间和电泳的电参数。可选择干胶溶胀后自动进行等电聚焦电泳,也可选择在低电压下进行胶条的带样品溶胀,减少蛋白之间形成聚焦的可能。仪器一共可编辑 9 个程序,每个程序含 9 个步骤。

 ( 2 )快速完成电泳

    工艺放大 Ettan IPG phor II 一次最多可跑 12 个 IEF 胶条电泳,配合 Ettan Dal tuelve 垂直制备板电泳系统能于 1.5 天内一次完成 12 个样品的蛋白双向电泳。

    高压输出 Ettan IPG phor II 内置电源,能输出高达 10000V 的电压,使电用时间缩短至 2 个小时,比传统所需的时间快 5 倍。

 ( 3 )有效温控、操作安全的设计

经典的水平电泳技术 平床式的等电聚焦电泳使操作更简便,使用半导体的温控( 18 -25 ℃ )效果更理想。

 ( 4 )高重复性结果 源于操作简易

   2 .第二相:垂直板电泳( SDS-PAGE )

   Hoefer SE600 Ruby 标准垂直电泳系统 SE600 自 1979 年开始一直是世界上公认的高质量的垂直电泳系统。

   特点:关键性的高效温控

  •  SE600 系列配用两种温控方法

  1 )玻璃板浸泡在缓冲液里可恒定电泳时温度

  2 )内置式的热量交换器通过两端的接口跟循环浴联接,电泳时凝胶可在 1 ℃ 至 45 ℃ 进行电泳

   •  高适应性:迎合大量、快速的实验要求

  根据不同需要, SE600 可跑标准胶( 14 ⅹ 16cm )外,也可进行短板胶( 14 ⅹ 8 cm )电泳,电泳时间大大缩短。

  SE600 每次可跑 4 块板胶。利用三明治式的玻璃板组合使电泳槽的每一边能跑 2 块胶。

    梳子有 5-28 个加样孔供选择,另有制备型梳子( 2 个加样孔),适合进行双向电泳的第二相电泳。如果进行多种样品电泳,可使用 28 个加样孔的梳子,一次跑 4 块胶。

  •  优质的仪器构建,用料上乘

    SE600 的上层缓冲液槽是用聚砜树脂制成,其具有高抗拉强度,抗化学腐蚀,抗压、抗高温等优点,由聚丙烯制成的下层缓冲液槽也非常耐用。

 

  (三) Wallac VICTOR3TM 多标记检测仪

    用途:用于微孔板的荧光(顶部和底 部)、化学发光和光吸收(包括紫外 和可见光)检测。

   •  性能:兼容各种规格的微孔板;与计算机连接,具有扫描功能;具有动力学检测分析系统(快速、慢速、单标记、双标记);可以转动的滤光片轮,提供 8 个滤光片 位置。可见光 (340-800nm) , 荧光 、化学发光 (355nm 和 485nm) , UV ( 260nm 和 280nm) 。