《生物医学信息检索与利用》教学大纲

    教学层次：专科生、本科生、硕士研究生、在职人员等，由于生源不同，教学要求、所学内容、考核方法有一定差别；
  一、教学目的：
    本课程是一门以文献信息及其相关检索系统的特点及使用方法为研究对象，旨在使学生了解并掌握各种信息检索技术，学会运用各种检索手段从各类信息源中获取所需要的知识。从而提高学生获取信息的能力，尤其是网上医学信息的分布及查找方法。为其将来从事医学临床、科研、教学工作，以及实现知识更新的继续教育奠定一个良好的基础。

  二、要求：　
    1、掌握若干种基本的综合性和专业性中外文检索工具，了解其内容特点、结构和著录格式，能够通过多种途径使用它们检索与专业相关的不同类型文献。
    2、掌握计算机检索的方法，包括选择数据库、制订检索策略、分析检索结果。
    3、掌握网上获取信息的方法。
    4、掌握文献信息的分析研究方法及具体应用。
  三、教学内容：
    本课程主要介绍信息源与信息检索的基本知识、信息组织方法、各种类型的信息检索系统与检索技术、网络信息检索工具及其使用方法等。主要章节如下：
第一章: 医学文献检索与利用概论 ——如何使用图书馆
  [教学内容]

    1、图书馆的功能与作用

    2、文献检索基本概念

    3、检索语言

    4、美国医学文献检索体系简介

    5、中国医学文献检索体系简介

    6、馆藏文献数据库简介

    7、网络期刊文献全文获取途径和方法

    [目的要求]
    了解：科技文献检索基本概念和医科院图书馆馆藏及服务特点。
    理解：文献资源和图书馆，文献数据库和文献检索语言的关系；
    图书馆是终身学习的课堂。
    掌握：获取中外文文献全文，特别是网络环境下获取数字资源全文的渠道和方法。

第二章：美国生物医学信息检索系统
    [教学内容]

    美国《医学索引》概况及其基本的检索方法；

    光盘检索软件WINSPRIS的界面和基本功能；

    医学主题词表Mesh词表概述；

    美国MEDLINE数据库概况；M,EDLINE的数据格式；

    MEDLINE光盘数据库的检索方法和实例；检索结果的处理；

    网络检索系统PubMed数据库概况；PubMed的数据格式；

    利用Entrez检索PubMed数据库的方法和检索结果的处理；

    [目的要求]
    了解：美国国立医学图书馆检索系统的历史沿革；手工检索工具《医学索引》的体例结构和使用方法。
    理解：MEDLINE光盘检索的基本原理；布尔逻辑运算的原理；Mesh词表的编制原理和结构；MEDLINE和PubMed数据库的数据格式；PubMed自动扩展检索的过程。
    掌握：MEDLINE和PubMed数据库的各种检索方法；对于检索结果的处理（显示、下载和打印）；三种不同载体检索工具之间的联系和区别。

    中文生物医学文献检索系统

    [讲授内容]

    中国生物医学文献数据库（CBMDisk）概况及其基本的检索方法；

    中文生物医学文献全文数据库。

    中文生物医学信息的网络搜索

    [目的要求]

    理解并掌握国内编辑出版的医学及相关学科检索工具的收录范围、编排特点

    掌握CBMDisk检索方法。

第四章：荷兰《医学文摘》与美国《生物学文摘》
    [教学内容]

    荷兰《医学文摘》概况及其历史沿革；

    光盘数据库及其字段的介绍；

    EMBASE 的主题词检索；

    EMBASE光盘数据库的检索方法和实例；检索结果的处理；

    美国《生物学文摘》概况及其手工本介绍；

    光盘数据库及其字段的介绍；

    BA on CD的检索方法和实例；检索结果的处理；

    BIOSIS Previews的概况和检索方法的介绍；

    EMBASE、BIOSIS Previews和MEDLINE三种数据库的比较。

    [目的要求]
    了解：BA与BIOSIS? Previews之间的联系和区别；BIOSIS? Previews的检索方法；三大生物医学检索系统EMBASE、MEDLINE、BIOSIS? Previews在收录范围、著录方式、检索途径之间的差异。
    理解：EMTREE的发展历史沿革；EMBREE的取词规则；EMBASE主题词检索方法；EMBASE和BA? on CD数据库的数据格式、特征字段的含义。
    掌握：EMBASE和BA? on CD数据库的各种检索方法；对于检索结果的处理（显示、下载和打印）；与MEDLINE光盘数据库检索方法的异同。

第五章：循证医学信息检索
    教学内容]

    循证医学的重要发展历程及其在国内外开展的现状；

    循证医学临床研究证据及分级；

    循证实践及研究步骤；

    诊断、治疗、病因、预后等临床研究证据的评价方法；

    以PubMed和CBMdisc为例介绍循证医学思维在信息检索中的运用：从基于文献主题内容的检索向基于临床研究方法学的检索转变；

    Cochrane Library等网络循证医学信息资源的检索与利用；

    [目的要求]
    了解：循证医学的重要发展历程；循证医学在国内外开展的现状。
    理解：诊断、治疗、病因、预后等临床研究证据的评价方法
    掌握：循证医学临床研究证据及分级；循证实践及研究步骤；循证实践指南，系统评价，诊断、治疗、病因和预后等临床研究证据的检索，中文循证证据的检索。

第六章：美国《化学文摘CA》
    [教学内容]

    美国《化学文摘》（《CA》）的概况、特点；相应的产品、版本；

    印刷版《CA》的编排、索引系统（期、卷、累积索引）、辅助工具（CAS登记号、索引指南、CASSI）；

    印刷版《CA》的检索方法（检索举例）；

    光盘版CA的检索界面、检索途径和使用方法；

    网络版《CA》的种类、概况；

    国内用户查找《CA》的途径。

    [目的要求]
    了解：《CA》的历史沿革、特点；光盘版《CA》的检索途径、检索界面和使用方法，网络版的种类和提供者；
    理解：期索引、卷索引、累积索引、索引指南和《CA》文摘的组织方法；；索引之间的相互关系；
    掌握：《CA》收录文献类型的辨别；印刷版《CA》中各种文献的编排规律；期、卷、累积索引的编排结构、检索途径和检索方法；索引指南的使用方法，注意事项；CAS登记号在检索化学物质中的作用。

第七章 网络生物信息检索
    [教学内容]

    1、网络搜索引擎概况

    2、主要的医学搜索引擎介绍

    3、各种类型的生物医学信息的搜索

    [目的要求]
    理解：
    4、网络搜索引擎的原理
    5、主要网络搜索引擎的使用方法
    6、各种类型医学信息的搜索方法
第八章 网络中文数据库生物信息检索
    [教学内容]

    中文文献数据库发展概况

    主要的医学文献数据库检索方法介绍

    各种生物医学信息的检索方法

目的要求]
    理解：

中文文献数据库编制的原理

主要检索方法的使用

各种类型医学信息的分析方法

第九章 网络外文数据库生物信息检索
[教学内容]

外文文献数据库发展概况

主要的医学文献数据库检索方法介绍

各种生物医学信息的检索方法

[目的要求]
理解：

外文文献数据库编制的原理

主要检索方法的使用

各种类型医学信息的分析方法

第十章：文献信息分析研究方法论
[教学内容]

文献信息分析研究方法论概论

文献信息的定性分析和定量分析

3． 文献计量学方法在医学领域的应用
[目的要求]

掌握文献信息分析基本内容

熟悉文献信息的定性分析和定量分析

掌握文献计量学方法在自己学科领域的应用和相关文献信息

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